户部给每个州县分别下拨了两千两银子作为新政的经费，用在雇请名医、负责受训学员的食宿等方面的花费上。

　　“诸卿做的不错，此项新政非一时一日能见功效，须常抓不懈、持之以恒为佳；朕于闲暇时亦曾静心虑及此事，为免新政因种种制约半途而废，特决意成立专责此事之有司，所有与之相关人员物资配属均由其全权负责，新建有司暂名卫生署，署正为正四品之职，首任署正由太医院院判吴有性担任，其余官员吏目品级、员数由内阁与吏部会商后决定。卫生署直属内阁管辖，其职责权限由内阁商议后呈报上来，其署衙由阁臣选址新建，望内阁诸卿将其职司制订详尽，朕会斟酌考量其中利弊后予以推行！”

　　有鉴于目前形势正在向好的方面平稳运行，那么在大明有条件的地方，有步骤的推行基本卫生常识便被朱由检提上了议事日程。

　　由卫生署出面，当地官府配合，在县城村镇开展消灭老鼠、苍蝇、蚊子、蟑螂的大扫除运动，推广饭前便后洗手、凉水必须烧开后方能饮用、夏天饭食隔夜必须加热食用、重大传染性疾病施行隔离、村镇茅厕改造等一些列举措，从根本上整治村镇的卫生环境，杜绝因为个人和环境卫生问题引发的种种疾病，这就是朱由检设置卫生署的初衷。

　　而这些即将展开的农村环境卫生整治，所需费用由內帑与户部共同负担，其中內帑出资占到七成。

　　至于以后是否在人口密集地设置公立医院一事，现在只能列入计划，但要根据具体情况再决定如何实施。

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